Essa questão ocorre quando no cadastro do ambiente é definido como um ambiente de terceiro e o CNPJ do ambiente de terceiro um é de uma filial da empresa.
Em casos de filais, o ambiente não deve ser definido como um ambiente de terceiro e sim como do próprio empregador.
Voce deve acessar mapeamento > ambientes > Editar o ambiente > Defina a opção como '1: Estabelecimento (matriz ou filial) Empregador' e gerar o evento novamente.